真微書屋印學資料庫規劃的主要檔案結構有:印人檔、印章檔、邊款檔、印學著作檔、印學論文檔、印論片語檔及印人事蹟檔——
印人檔主要收錄宋元明清以降至民國近代的篆刻家基本資料為目標,包括印人圖像、生卒年、籍貫、字號、齋館、師承或派別、主要著作及生平述要等,除了篆刻家外也廣收當時代之書家、畫家及印友(泛指對印章有收集嗜好者或對印藝有相當關懷者)之資料。
印章、邊款檔主要收錄宋元明清以降至民國近代以來印人所刻的印章及邊款(古璽印或作者不詳之印作暫緩)為目標,檔案實分為印章檔及邊款檔,再加以關連在一起。檔案收錄內容包括印面圖片、邊款圖片、印文、邊款釋文、刻印年代、刻印作者、印章主人及各種分類:如印文的字體、陰陽刻屬性、形狀尺寸、印文性質、印文章法、邊款體例、邊款字體、邊款刀法及邊款內容性質等等。
印學著作檔主要收錄宋元明清以降至民國近代以來相關印學的著作集、原拓印譜、印刷印譜、書畫印雜誌、字典….等書籍為目標,檔案內容包括書名簡稱、書籍全名、內容述要、性質分類、編著者、序跋者、出版單位及開數、頁數等資料。
印學論文檔主要從印學著作中摘錄本文、或從印譜中摘錄跋序題記等文章、或從印章邊款中摘錄有關印論等等,並依論文性質分類建檔。檔案內容包括論文作者、年代、資料出處、性質分類及關連印人等資料。
印論片語檔係從印學論文的本文中摘錄出適當的段落印話,或從印章邊款中摘錄出有關印話,並依該印話之性質分類建檔。檔案內容包括印話原文、印話作者、年代、資料出處、性質分類及關連印人等資料。
印人事蹟檔為印人之重要事蹟里程表,內容主要收錄相關印人親友事略、考試、做官、作文、作書、作畫、編著書籍印譜及遊歷交友等相關事蹟,皆依年代分類。並可隨時加入印章檔中之印人刻印資料或印學著作檔中印人著作資料,可產生豐富詳實的印學年表。
真微書屋印學資料庫主要檔案架構下,還有許多支援檔案,可補充主檔資料使更加豐富詳實。例如印人檔案下有支援印人之印人書法資料檔及印人繪畫資料檔,可補充對印人更深入的認識;也可由印學論文檔中產生與印人相關之論文檔,可輔助對印人更全面的了解;印章、邊款檔下支援有印材檔,可補充對該印章現階段藏處及印材現況作更深入的了解。印章、邊款檔下同時也支援有印章收錄檔,記錄了相同一方印章的收錄,分別取材的出處及其鈐拓狀況的比較。除了主檔架構下的個別支援檔案外,另有年代對照檔屬於全面性的支援,提供了任一檔案中公元年與中國朝代年號、干支或歲星陰陽紀年的對照,甚或日本、朝鮮等鄰國的年號對照也一應俱全。 而主檔中的印人檔同時也是全面性的支援檔案,無論在印章、邊款檔、印人事蹟檔或印學著作檔…中,只要檔案中有相關人名的記錄,皆可啟動印人檔中的資料加以支援。所以整個印學資料庫中的所有檔案,都是彼此相互密切關連的,可隨時掌握周全的資訊,也可免掉許多重複輸入的困擾,確實發揮資料庫電腦化所帶給我們的便利。
真微書屋印學資料庫的應用程式主要是透過 PARADOX 資料庫軟體設計而成的, 由最早的PARADOX1.0 , PARADOX7 到最近的 PARADOX 10; 其他文書或影像的資料則分別使用 MS/Word 、WordPro、PhotImpact 等應用軟體來處理。整個作業環境 由最早的MS/DOS, Window 95, Window 98, Window 2000 到最近的 Window XP , Window NT作業系統。